一、藥物治療：對于較小較少的損害。
(1)5％5-Fu軟膏 5-Fu是一種常用的抗腫瘤藥物，它能抑制細胞的增殖，力量較為溫和，一般需治療2～3周。
(2)醋酸：三氯醋酸是一種強酸，可用來燒灼疣體，一般用于治療Ⅱ型病變。涂抹前先用棉球醮２％的卡因貼敷于病變局部３￣５分鐘后，用棉簽醮５０％三氯醋酸涂抹病變，使藥液達基底部；涂藥時注意勿傷及周圍健康粘膜組織，經期勿用；每周用藥2次。或用20%柳酸冰醋酸外搽。
二、微波治療：這是進入90年代后興起的治療方法。它的原理是利用微波的高頻震動，使疣體內部水分蒸發，壞死脫落。微波治療的特點是，疣體破壞徹底，不易復發，但創面恢復較慢，容易繼發感染。所以微波治療特別適用于治療疣體較大的，孤立、散在的，同時要遠離包皮系帶的尖銳濕疣，以防損傷包皮系帶，影響男性的性功能。
三、冷凍治療：液氮或二氧化碳干冰冷凍，使疣組織（即皮膚損害局部）壞死。尖銳濕疣是由于尖銳濕疣病毒的感染，導致皮膚粘膜的良性增生。它有大量的小血管，增殖迅速。用冷凍的方法可使尖銳濕疣內結冰，形成組織局部的高度水腫，從而破壞疣體。冷凍治療的最大好處是局部不留痕跡，治愈率約70％左右。治療過程中除局部紅腫，疼痛及水皰反應外，一般無明顯后遺癥。可用噴霧法或直接接觸法，適用于平坦較小的疣體。一般每周冷凍1次，連續2～3次。一般月經后治療。
四、激光治療：對外陰、肛門周圍等表淺的濕疣合適；它的特點是見效快，在治療的當時，疣體即可脫落。常用的是二氧化碳激光，燒灼疣體，一般1次即可使疣體脫落。但是，由于激光的光束過于集中的原故，激光治療只適用于疣體較小的尖銳濕疣，如疣體較大，激光治療很容易復發。治愈率可達80%。
五、電灼治療：電燒灼是較老的一種治療方法。過去皮膚科醫師常用高頻電刀或電烙鐵燒灼尋常疣、色素痣及其他皮膚贅生物。它的特點是操作簡單，見效快。高頻電刀能直接切除和干燥疣體，治療也較徹底，但是，電燒灼瘡面愈合較緩慢。綜上所述，電燒灼治療，可用于任何尖銳濕疣的治療，但是對施術者的技術要求較高，燒灼太過或不足都是有害的。同時要注意無菌操作，預防感染。高頻電刀或電針，對宮頸或陰道較小病損治療較合適。較大的疣則需分批電灼。
六、手術切除：對帶蒂的較大、孤立的疣體可考慮手術切除。尖銳濕疣一般不主張手術切除，因為手術治療后，尖銳濕疣很容易復發，使治療失敗。但對帶蒂的較大的疣體或疑有惡變者，可考慮手術切除。有的患者尖銳濕疣生長過于迅速，或大如菜花，其他治療十分困難，可考慮手術治療。為防止復發，術后配合其他治療。根據疣塊、覆蓋面積，選擇病灶切除或外陰切除。
七、手術刮除法：治療時左手將病變部位的皮膚或粘膜繃緊，或手持消毒刮匙自根部稍用力將病變組織刮除；關徹底清除創面的殘余病變組織，然后用33%三氯醋溶液或純碳酸溶液或3%氯化鐵液涂局部。
八、手術結扎法：適用于單個有蒡的小病灶，局部消毒和局麻后；用鑷子將疣組織提起，用止血鉗夾根部，再用1號絲線扎基基底部，一般于結扎后3-5天，疣體即可脫落。
傳統的物理治療方法，如冷凍，激光，電烙，手術等，僅僅能夠破壞疣體表面組織，術后必須另外進行抗病毒治療，患者痛苦大，治療時間長，費用昂貴，也容易因為人體自身免疫能力下降而反復發作。資料顯示表明，如果單純采用激光等方法治療，47.5%的病人在七天以后即復發，并留下巴痕，影響愈后正常的夫妻生活，給患者帶來長期的精神痛苦。三氮醋酸，或其他腐蝕性及強的化合物，以單純腐蝕消除疣體為目的。雖然見效快，價格低廉，但與物理治療方法一樣，雖然能在短時間內消除疣體，但治標不治本，極易復法。我院針對這一情況，推出了“疣苗”療法。即：在物理療法去除疣體后，深部肌肉注射我院針對尖銳濕疣難治愈、易復發等特點研制的純化疫苗，收到了滿意的療效。
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