最常見的子宮內膜異位癥所影響的器官有：卵巢、子宮后壁、子宮直腸凹陷部位、子宮頸、直腸、腹膜、尿道、膀胱、會陰、輸卵管、腹壁、胸部、手臂、腿部、中樞神經系統。事實上子宮內膜異位癥除了脾臟外，在身體的各個部位都有可能存在。
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